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[00300927]基于R‑SVM和TPR规则的基因功能预测方法

交易价格: 面议

所属行业: 分析仪器

类型: 发明专利

技术成熟度: 正在研发

专利所属地:中国

专利号:CN201610452114.9

交易方式: 技术转让 技术转让 技术入股

联系人: 哈尔滨工业大学

进入空间

所在地:黑龙江哈尔滨市

服务承诺
产权明晰
资料保密
对所交付的所有资料进行保密
如实描述
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技术详细介绍

摘要:基于R‑SVM和TPR规则的基因功能预测方法,涉及一种基因功能的预测方法。本发明可以实现对基因功能的预测,能够解决采用分类算法实现基因功能预测时所存在的多标签问题以及层级约束问题。本发明首先将已知功能的基因作为训练样本,构成训练集;针对GO注释方案中的每个节点,构造正样本集和负样本集;针对GO注释方案中的每个节点,选择对该节点的功能进行分类时贡献较大的属性;通过训练得到一组R‑SVM分类器并对未知样本进行分类预测,得到一组初步R‑SVM分类结果;将分类结果转化为后验概率值,使用针对有向无环图层级结构的带权重的TPR集成算法,实现基因功能的预测。本发明适用于基因功能的预测。
摘要:基于R‑SVM和TPR规则的基因功能预测方法,涉及一种基因功能的预测方法。本发明可以实现对基因功能的预测,能够解决采用分类算法实现基因功能预测时所存在的多标签问题以及层级约束问题。本发明首先将已知功能的基因作为训练样本,构成训练集;针对GO注释方案中的每个节点,构造正样本集和负样本集;针对GO注释方案中的每个节点,选择对该节点的功能进行分类时贡献较大的属性;通过训练得到一组R‑SVM分类器并对未知样本进行分类预测,得到一组初步R‑SVM分类结果;将分类结果转化为后验概率值,使用针对有向无环图层级结构的带权重的TPR集成算法,实现基因功能的预测。本发明适用于基因功能的预测。

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