[01412184]基于多关系蛋白质网络模型的功能模块挖掘与功能预测
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网络
类型:
非专利
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技术详细介绍
1、主要研究内容:
(1)多关系蛋白质相互作用网络中功能模块挖掘方法研究。
(2)多关系蛋白质相互作用网络中关键蛋白质识别算法研究。
(3)多关系蛋白质相互作用网络中蛋白质功能预测方法研究。
2、主要科学发现点:
(1)在功能模块挖掘方法研究方面:
构建多关系蛋白质网络,提出一种基于core-attachment的蛋白质功能模块挖掘方法;提出一种评估关键模块重叠率的度量方法。
(2)关键蛋白质识别算法研究方面:
根据关键蛋白质的模块特性,提出一种基于功能模块和加权网络的关键蛋白质识别方法;建立不确定网络模型,提出一种关键蛋白质识别方法。基于上述方法,有效地提高了关键蛋白质识别的准确率。
(3)蛋白质功能预测方法研究方面:
根据蛋白质相互作用网络拓扑特性分析,并结合多源生物数据与功能的关联分析,分别建立动态蛋白质网络和多关系蛋白质网络,并成功应用于蛋白质功能预测,有效地提高了功能预测的准确率。
3、主要科学价值:
为了克服蛋白质相互作用网络中的噪声和不完整性对预测造成的负面影响,结合多源生物数据,建立基于时序和空间的多关系网络模型。成功地将多关系网络模型应用于功能模块挖掘、关键蛋白质识别和蛋白质功能预测,有效地提高了预测的准确率。
4、同行引用及评价:
该项目研究成果被国内外同行在“Briefings in Bioinformatics”、“Methods”、“计算机研究与发展”、“自动化学报”等知名学术期刊上他引28次。其中单篇最高他引频次7次。最高他引期刊影响因子为9.101。
1、主要研究内容:
(1)多关系蛋白质相互作用网络中功能模块挖掘方法研究。
(2)多关系蛋白质相互作用网络中关键蛋白质识别算法研究。
(3)多关系蛋白质相互作用网络中蛋白质功能预测方法研究。
2、主要科学发现点:
(1)在功能模块挖掘方法研究方面:
构建多关系蛋白质网络,提出一种基于core-attachment的蛋白质功能模块挖掘方法;提出一种评估关键模块重叠率的度量方法。
(2)关键蛋白质识别算法研究方面:
根据关键蛋白质的模块特性,提出一种基于功能模块和加权网络的关键蛋白质识别方法;建立不确定网络模型,提出一种关键蛋白质识别方法。基于上述方法,有效地提高了关键蛋白质识别的准确率。
(3)蛋白质功能预测方法研究方面:
根据蛋白质相互作用网络拓扑特性分析,并结合多源生物数据与功能的关联分析,分别建立动态蛋白质网络和多关系蛋白质网络,并成功应用于蛋白质功能预测,有效地提高了功能预测的准确率。
3、主要科学价值:
为了克服蛋白质相互作用网络中的噪声和不完整性对预测造成的负面影响,结合多源生物数据,建立基于时序和空间的多关系网络模型。成功地将多关系网络模型应用于功能模块挖掘、关键蛋白质识别和蛋白质功能预测,有效地提高了预测的准确率。
4、同行引用及评价:
该项目研究成果被国内外同行在“Briefings in Bioinformatics”、“Methods”、“计算机研究与发展”、“自动化学报”等知名学术期刊上他引28次。其中单篇最高他引频次7次。最高他引期刊影响因子为9.101。